Gördes Çayı'nın su yönetimi, bölgedeki su kaynaklarının etkin kullanımı ve korunması açısından büyük bir öneme sahiptir. Su yönetimi uygulamaları, yerel ekosistemlerin sürdürülebilirliğini sağlamak ve su ihtiyaçlarını karşılamak için titizlikle planlanmaktadır. Bu süreçte, çeşitli teknikler ve projelerle hem tarımsal hem de içme suyu temini üzerinde durulmakta, su sızıntılarıyla ilgili sorunlar çözülmeye çalışılmaktadır.

Gördes Çayı'nın su yönetimi, Gördes Barajı üzerinden gerçekleştirilmektedir. Bu kapsamda yapılan bazı çalışmalar şunlardır:

• beton enjeksiyonu ve geomembran uygulaması: Barajdaki su sızıntılarını önlemek için bu yöntemler kullanılmıştır.
• Marmara Gölü'ne su temini: Barajdan, kuruyan Marmara Gölü'ne su sağlanması planlanmaktadır.
• Tarımsal sulama: Baraj, 19.260 hektarlık bir tarım alanının sulanmasında kullanılmaktadır.
• İçme suyu temini: İzmir'in içme suyu ihtiyacının bir kısmı bu barajdan karşılanmaktadır.

Ayrıca, kuraklık yönetim planları kapsamında, Gördes Çayı havzasında su potansiyeli ve sektörel etkilenebilirlik analizleri yapılmakta, kuraklık etkilerini azaltmak için önlemler geliştirilmektedir.