Afyon Eber Gölü, hem doğal güzellikleri hem de zengin biyolojik çeşitliliği ile dikkat çeken bir ekosistemdir. Bu göl, yerel flora ve fauna için önemli bir habitat sunarken, kuş göç yolları üzerinde stratejik bir konumda yer alması nedeniyle uluslararası öneme sahiptir. Eber Gölü, hem doğal yaşamı koruma çabaları hem de ekoturizm potansiyeli açısından önemli bir merkez haline gelmiştir.

Afyonkarahisar Eber Gölü'nün doğal yaşamı şu şekilde özetlenebilir:

• Bitki örtüsü: Göl, kırmızı kamış türünü de barındıran bitki örtüsüne sahiptir. Ayrıca, yerli halkın "kopak" adını verdiği, su üzerinde kamış köklerinin oluşturduğu yüzer adacıklar bulunur.
• Hayvan çeşitliliği: Eber Gölü, çeşitli kuş türleri ile bazı balık türlerine ev sahipliği yapar. Özellikle Afrika-Sibirya kuş göç yolu üzerinde yer alması, gölü uluslararası düzeyde önemli bir kuş konaklama alanı haline getirmiştir.
• Endemik türler: Gölde, Eber Sarısı adlı endemik bitki türü yetişir.

Ancak, gölde son yıllarda artan kirlilik ve su miktarındaki azalma nedeniyle canlı çeşitliliği tehdit altına girmiştir.