Aktepe'nin doğal oluşumu, bulunduğu coğrafyanın özellikleriyle şekillenmiş karmaşık bir süreçtir. Her bir Aktepe, çevresindeki jeolojik yapıların etkisiyle farklı karakteristik özellikler taşır. Örneğin, volkanik kökenli tüf yapıları veya traverten oluşumları gibi çeşitli doğal unsurlar, bu muhteşem yapıları meydana getiren unsurlardır. Bu bağlamda, Aktepe'nin doğası, hem tarihsel hem de jeolojik açıdan büyük bir öneme sahiptir.

Aktepe'nin doğal oluşumu, bulunduğu bölgeye göre değişiklik göstermektedir:

• Afyonkarahisar'daki Aktepe: Demirli köyünün batısında, kuzeydoğu-güneybatı uzantılı, beyaz ve krem rengi nedeniyle çevredeki tepelerden kolaylıkla ayırt edilebilen volkanik tüf kayalıktır.
• Kapadokya'daki Aktepe: Milyonlarca yıl önce başlayan jeolojik bir süreç sonucu oluşmuştur. Eski volkanik patlamalar, bölgeyi tüf adı verilen yumuşak bir kayayla kaplamıştır. Rüzgar ve suyun doğal erozyonu ile sert elementler geride kalarak Peri Bacaları'nı oluşturmuştur.
• Aktepe Travertenleri: Jura-Alt Kretase yaşlı volkanikler ile kireçtaşının etkisiyle oluşmuştur. Yağışlar sonucu sızan sular, kalsiyum karbonat biriktirerek Aktepe travertenlerini oluşturmuştur.